在醫學界,血液腫瘤是一類具有高度異質性的疾病,其診療需要結合形態學、免疫學、遺傳學和分子生物學進行綜合分析。血液腫瘤中常見的分子生物學異常主要包括基因突變、融合基因及基因異常表達。目前NGS在基因突變的檢測方面應用最為廣泛和成熟,CEIDI西遞在本文整理的內僅涉及基因突變的檢測。
二代測序NGS實驗室,是一種用于基因檢測(高通量測序檢測)的實驗室,建設二代測序NGS實驗室的重點,主要在設計布局分區、 結構材料、氣壓調節、消毒、照明、傳遞窗幾個方面。
二代測序(NGS)實驗室裝修設計行業規范 CEIDI西遞
一、二代測序NGS實驗室的設計布局分區
二代測序NGS實驗室的設計分區,主要將實驗室劃分為4個區域,即:試劑準備區、標本與文庫制備區、文庫擴增與檢測區、測序區。
1. 試劑準備區
NGS實驗室試劑準備區的區域功能及儀器配備如下:
(1)區域功能:用于實驗項目所需試劑的配制、分裝和保存。
(2)儀器配備:必須配備加樣器、冰箱、分析天平、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、移液器、可移動紫外燈、超凈工作臺等儀器設備。
2. 標本與文庫制備區
NGS實驗室標本與文庫制備區的區域功能及儀器配備如下:
(1)區域功能:用于血液處理、血漿制備、DNA提取、DNA片段化、DNA樣品的純化、DNA濃度檢測、末端修復、接頭連接、構建樣本的測序文庫。
(2)儀器配備:必須配備冷凍離心機、微量臺式離心機、掌上三管離心機、渦旋震蕩器、垂直混合儀、移液器、可移動紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤天平、Qubit 2.0核酸定量儀、電腦(可連接互聯網)、條形碼打印機、普通打印機、掃描槍、磁力架等儀器設備。
3. 文庫擴增與檢測區
NGS實驗室文庫擴增與檢測區的區域功能及儀器配備如下:
(1)區域功能:用于文庫構建后的PCR擴增與純化、文庫濃度檢測、文庫的混合及混合后的質檢分析。
(2)儀器配備:必須配備PCR儀、QPCR儀、Qubit2.0核酸定量儀、可移動紫外燈、超凈工作臺、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等儀器設備。
4. 測序區
NGS實驗室測序區的區域功能及儀器配備如下:
(1)區域功能:用于測序模板制備,如乳液PCR與磁珠富集回收,以及上機測序、數據分析、報告審核及發放。
(2)儀器配備:必須配備高通量測序儀、PC電腦、打印機、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺式離心機、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺、可移動紫外燈、磁力架、PCR儀等儀器設備。
二、二代測序NGS實驗室的主體結構材料
二代測序NGS實驗室設計裝修要以彩鋼板與鋁合金材料為主體建材,室內陰角與陽角采用鋁合金50內圓角鋁,這樣做的好處是內部結構牢固、密封性好,且不易污染、積塵。
三、二代測序NGS實驗室的氣壓調節
二代測序NGS實驗室在氣壓調節上,要在實驗區的外墻和各扇門上安裝風量可調的回風口,空氣通過回風口向室內換氣。
四、二代測序NGS實驗室的消毒與照明
在消毒上,二代測序NGS實驗室的實驗區、緩沖區頂部、傳送窗內部要配備用于消毒的紫外燈。如果要對實驗桌進行局部消毒,還要配備移動紫外線燈;在照明上,照明設備必須不積塵、易清潔才行,這里CEIDI西遞建議配備凈化燈具。
五、二代測序NGS實驗室的傳遞窗
傳遞窗分為機械連鎖型與電子連鎖型,二代測序NGS實驗室設計裝修建議配備前者,以便確保樣本與試劑在傳遞過程中不會受到污染。